Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL33A6NCF5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms