Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms