Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms