Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNSTRNQ9Y448 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNSTRNQ9Y448 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms