Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2J1Q9Y385 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms