Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP3Q9Y2W7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms