Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCE1Q9Y256 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RCE1Q9Y256 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms