Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBEC2Q9Y235 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms