Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SHANK2Q9UPX8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SHANK2Q9UPX8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms