Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP18Q9UMW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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