Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CIZ1Q9ULV3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIZ1Q9ULV3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIZ1Q9ULV3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIZ1Q9ULV3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CIZ1Q9ULV3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms