Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA11Q9UKX5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms