Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSKSQ9UJT2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSKSQ9UJT2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms