Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms