Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIP2Q9UDT6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms