Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPG2Q9UBF2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms