Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL13Q9P2N7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms