Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms