Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPRMQ9NS64 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPRMQ9NS64 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms