Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDFQ9HBH1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms