Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPF2Q9HAU5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms