Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOJQ9H4E5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms