Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2J2Q9GZM3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms