Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CIPCQ9C0C6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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