Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms