Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KATNB1Q9BVA0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms