Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGPD5Q99666 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD5Q99666 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms