Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PKP4Q99569 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms