Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIN3AQ96ST3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SIN3AQ96ST3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms