Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC9Q96Q05 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC9Q96Q05 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms