Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms