Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM227BQ96M60 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms