Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms