Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPACA9Q96E40 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms