Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TRIM63Q969Q1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM63Q969Q1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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