Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms