Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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