Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNBD1Q8NA66 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms