Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF554Q86TJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms