Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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