Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOP1Q7RTM1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms