Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP50Q70EL3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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