Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA5Q6Q788 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms