Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
UFSP1Q6NVU6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms