Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF20Q5VT98 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF20Q5VT98 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms