Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM78BQ5VT40 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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FAM78BQ5VT40 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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FAM78BQ5VT40 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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