Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARFGEF3Q5TH69 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms