Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COL5A1-AS1Q5SY13 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms