Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms