Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms